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344 人阅读发布时间:2024-07-19 15:44
实时荧光定量PCR
实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,简称qPCR)是一种高灵敏度的核酸定量技术,它结合了PCR扩增技术与荧光标记技术,能够在PCR扩增过程中实时监测DNA的扩增情况,并据此对目标DNA或RNA进行定量分析。该技术广泛应用于基因表达研究、疾病诊断、病原体检测等领域。
一、原理:
实时荧光定量PCR的原理是在PCR反应体系中加入荧光染料(如SYBR Green)或荧光探针(如TaqMan探针)。这些荧光物质可以与DNA双链结合,并在PCR扩增过程中随着DNA的增加而发出荧光信号。通过实时监测荧光信号的变化,可以反映DNA的扩增情况。荧光信号的强度与PCR产物的量成正比,从而可以通过荧光信号强度来推算出目标DNA或RNA的起始浓度。
二、材料与仪器:
实验试剂:
RNA酶抑制剂、TRIzol或其他RNA提取试剂、氯仿、异丙醇、乙醇、PCR酶、dNTPs、PCR缓冲液、特异性引物、荧光染料或探针、去离子水或RNA/DNA酶-free水等。
实验仪器:
离心管、移液器及吸头、离心机、PCR仪、PCR反应管或反应板、热盖或热封膜、涡旋混合器移液工作站、紫外分光光度计等。
三、实验步骤:
1、实验准备:
①收集待检测的DNA或RNA样品,确保样品的质量和数量满足实验要求。
②根据目标序列设计特异性引物,引物应具有合适的长度、GC含量和退火温度。
③准备PCR反应所需的各种试剂,包括PCR酶、dNTPs、缓冲液、荧光染料或探针等。
2、PCR反应体系配制:
①将设计好的引物进行适当稀释。
②将荧光染料或探针加入PCR反应体系中。
③加入准备好的样品、PCR酶、dNTPs和缓冲液等试剂,完成PCR反应体系的配制。
3、PCR反应:
将配制好的PCR反应液分装到PCR反应管或反应板中。设置PCR仪的反应程序,包括预变性、变性、退火、延伸等步骤的温度和时间。
在PCR反应过程中,通过PCR仪的实时荧光检测系统监测荧光信号的变化,并记录每个循环的荧光信号值。
4、数据分析:
绘制荧光信号曲线图,观察荧光信号的变化趋势。
设定合适的阈值,计算每个反应孔达到阈值时的循环数(Ct值)。通过比较不同样品之间的Ct值,实现对目标DNA或RNA的定量分析。
※实验结果示例:

QPCR-产物溶解曲线图

QPCR-实时扩增曲线图
四、注意事项
1、引物特异性:
引物的特异性对PCR扩增的特异性和效率至关重要,需要仔细设计和筛选引物。
2、防止平台效应:
PCR不能进入平台期,需要单独实验确定每个目标序列出现平台效应的循环数。
3、内参的设定:
使用内参(如G3PD、β-Actin等)来避免RNA定量误差、加样误差以及PCR反应体系中扩增效率不均一等造成的误差。